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文/陈守亮例如，我们描述了卵巢癌样本中原始RNA-seq数据的分析
，以定义排序gene list7。对reads进行质控和过滤（例如去除低质量碱基）并比对到全基因组范围的参考转录本，以对每个转录本比对到的reads进行计数。reads计数在基因水平上汇总（对每个基因计数）。通常
，可获得多个实验条件（两个或更多个，例如治疗和对照）中的每一个的多个生物学重复（三个或更多个）的RNA-seq数据。不同样品对应的每个基因的reads计数进行标准化
，以去除样品之间不必要的技术性差异（例如
，由于测序lane或每测序获得的总reads数的差异）26
，27
，28。接下来
，检验每个基因的reads数是否在样品分组之间存在差异表达（例如，处理与对照）（RNA-seq和芯片数据分别对应补充流程1和2）。R包如edgeR 29
，DESeq 30
，LIMMA / VOOM 31
，32和Cufflinks 33等
，用于RNA-seq数据标准化和差异表达分析。差异基因表达分析结果包括：（i）描述差异表达显著性的 P值; （ii）相关 Q值（又称校正后的 P.值
，是对所有基因的多重检验进行校正（例如
，通过使用BH-FDR程序34（box3））; （iii）表达变化的效应大小和方向
，上调的基因是阳性的
，在列表的顶部；下调的基因是阴性的
，在列表的底部，通常表示为log-transformed fold-change。然后依据一个或多个值对gene list进行排序（例如-log10 P值乘以log-transformed fold-change）
，进行通路富集分析研究。如果题目有多解，那么这个方法就不容易把所有解都找出来（第二题就会看到）。女人用手自熨的技巧

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　　刚刚召开的中央经济工作在“推动全方位对外开放”中首次提出，要适应新形势、把握新特点
，推动由商品和要素流动型开放向规则等制度型开放转变。这也意味着，一直强调制度创新的自贸试验区和自由贸易港，需要为这种转变，提供更多且更高质量的制度创新成果。刘喜海印近期有媒体爆料
，为了防止群里语音路演被转换成文字截屏转发
，国泰君安证券研究所所长黄燕铭在一个路演群中表示
，打算用上海话路演，如果有听不懂的，可以找人翻译。